未分化型甲状腺癌差异表达基因及其临床相关性研究

目的:探究与未分化型甲状腺癌转移和生存预后密切相关的关键靶基因,为甲状腺未分化癌的分子标志物作补充。方法:首先收集未分化型甲状腺癌的临床病理资料,并对患者的年龄、性别、TNM分期、淋巴结、远处转移等因素与生存预后相关性进行分析。其次选取GEO公共数据库GSE53072基因芯片数据,通过Network Analyst在线medial frontal gyrus数据库和Cytoscape软件找出未分化型甲状腺癌差异表达显著(P<0.01)的靶基因和Hub基因,并运用We Gestalt和KOBAS数据库对靶基因和Hub基因做GO富集分析和KEGG通路分析,筛选出甲状腺未分化癌的关键靶基因,利用STRING数据库对关键靶基因做蛋白相互作用网络分析。最后下载c Bio Portal数据库中包括TP53、TERT关键靶基因的未分化型甲状腺癌临床数据,分析验证未分化型甲状腺癌中TP53、TERT关键靶基因与年龄、性别、肿瘤分期、淋巴及远处转移、生存预后的相关性。结果:(1)33例未分化型甲状腺癌患者中发现,淋巴结转移、远处转移与生存预后有显著相关(P<0.01)。(2)基于GEO数据库,GSE53072数据集(标本:甲状腺未分化癌和正常组织)共筛选出2797个有差异性表达的基因,其中高表达基因1092个,低表达基因有1705个(矫正p值<0.05且log FC绝对值≥1)。(3)最终筛选出关键靶基因13个:TP53、TERT、PLK1、BUB1、MAD2L1、PTEN、CDC20、BMS-354825 NMRUBE2C、TPO、TG、IYD、FN1、COL1A1,其中与未分化型甲状腺癌淋巴结转移、远处转移、生存预后密切相关的关键靶基因有:TP53、TERT。(更多4)关键靶基因在未分化型甲状腺癌中可参与生物学调控、甲状腺激素合成、细胞周期、细胞黏附分子、调控肿瘤免疫浸润水平及PI3K-Akt信号通路等。(5)未分化型甲状腺癌中TP53、TERT基因突变组与未突变组病例相比,在年龄、淋巴结转移、远处转移、生存预后方面有显著差异(P<0.05)。(6)TP53在肿瘤免疫浸润中与B淋巴细胞、CD4~+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞及树突状细胞呈正相关(r均>0且P均<0.05);TERT与B淋巴细胞、CD8~+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞及树突状细胞呈正相关(r均>0且P均<0.05)。结论:(1)经验证未分化型甲状腺癌的生存预后,与淋巴结转移、远处转移有密切相关性。(2)挖掘未分化型甲状腺癌的关键靶基因13个,其中与未分化型甲状腺癌淋巴结转移、远处转移、生存预后密切相关的关键靶基因有:TP53、TERT。(3)TP53、TERT与甲状腺未分化癌的转移和生存预后密切相关,有望成为甲状腺未分化癌研究的潜在分子标志物,为甲状腺未分化癌的研究拓展新的研究方向。