J亚群禽白血病病毒(Subgroup J avian leukosis virus,ALV-J)是反转录病毒科(Retroviridae),甲型反转录病毒属(Alpharetrovirus)的成员,是引起鸡骨髓细胞瘤、血管瘤等肿瘤性免疫抑制病的病原。J亚群禽selleck KPT-330白血病在世界范围内呈地方性流行态势,给全球的养禽业带来了巨大的经济损失。近年来ALV-J一直处于快速变异和进化中,病毒的gp85基因以及基因组末端3’UTR(3’untranslated regPLX4032分子式ion)发生了不同程度的缺失,插入和重组突变。本研究开展了 2017-2022年间华东地区ALV-J分子流行病学调查,研究了gp85基因以及3’UTR变异对于病毒的复制效率,组织偏好性以及致病性等相关特征的影响。1 2017-2022年华东地区medieval European stained glassesALV-J分子流行病学为了解华东地区鸡群中ALV-J的感染情况,本研究对从2017-2022年间6个省疑似ALV-J感染的531份血液和临床样品进行病毒分离,亚型鉴定以及全基因测序。最终鉴定出131份ALV阳性样品,从中成功分离并且全基因测序了 31株病毒,包括ALV-A两株,ALV-B一株,ALV-K一株,ALV-J 27株。其中,27株ALV-J全基因长度为7431-7695bp,与ALV-J原型毒株HPRS103同源性为92.1%-93.5%。分离的ALV-J毒株gag基因与pol基因均相对保守,与HPRS103的同源性分别为94.2-95.3%和95.6-97.6%;27株中有22株在pol基因的C端有一个G到A的碱基突变,提前产生了 一个终止子,将Pol蛋白截短了 8个氨基酸。研究发现分离株间同源性为93.7%-99.2%。与原始毒株比较,env基因相似度为92.6%-96.1%,在进化树上可以分为三个大分支。变异遍及整个env,包括插入突变和缺失突变,尤其是藏鸡毒株TBC-J4以及TBC-J6在高变区hr2发生了显著的缺失突变。根据AlphaFold2预测的蛋白二级结构,不同毒株gp85蛋白形态结构较保守,均含有7-8个α-螺旋和9-11个β-折叠结构。66.7%(18/27)的ALV-J毒株在U3处出现11bp的缺失,导致这些毒株比以往毒株多了 2-3个转录因子结构域(motif),尤其是C/EBPalp结构域。3’UTR的序列分析结果显示,不同ALV-J在3’UTR处发生不同程度的突变,其中所有毒株均在r-TM处有…